KERAGAMAN GENETIK DAN DISTRIBUSI HAPLOGROUP TRENGGILING (Manis javanica Desmarest, 1822)
Abstrak: Kajian keragaman
genetik dari populasi trenggiling (Manis javanica Desmarest, 1822) belum banyak
dilakukan. Penelitian ini menganalisis sekuen fragmen D-loop DNA mitokondria
trenggiling, yang bertujuan untuk menyelidiki diversitas genetika trenggiling
dari dua populasi, yaitu kawasan konservasi dan lembaga konservasi di Sumatera
Utara dan Jawa. Fragmen D-loop DNA mitokondria yang teramplifikasi sepanjang
1129 pasang basa, terdapat 55 haplotipe dengan 120 situs, dan 12
haplogroup. Tiga frekuensi haplotipe
tertinggi dijumpai pada H-19 (9,09%), H-15 dan H-43 (3,64%), dan lainnya 1,8%.
Jarak genetik antar haplotipe trenggiling berkisar antara 0,001-0,099 dengan
rata-rata 0,012. Jarak genetik haplogroup dengan reference berkisar
0.001-0,019; jarak genetik dalam haplogroup berkisar antara 0,003-0,015; jarak
genetik antar haplogroup berkisar 0,003-0,021, dan jarak genetik antara haplogroup
dengan outgroup berkisar 0,0940,109. Diversitas nukleotida (Pi) sebesar 0,008
dan diversitas haplotipe (Hd) 0,994±0,006, yang menunjukkan keragaman genetik
yang tinggi. Hasil Tajima test pada jarak genetik antar haplotipe populasi
trenggiling menunjukkan nilai D: -2,337 (berbeda nyata pada taraf P<0,1),
sedangkan hasil Fu and Li's test menghasilkan D: -4,444 dan F: -4,337 (berbeda
nyata pada taraf P<0,02). Hal ini merupakan indikator tingginya keragaman
genetik dan ekspansi populasi trenggiling.
Kata Kunci: Trenggiling; DNA
mitokondria; haplotipe; genetika
Penulis: Reny Sawitri, Mariana
Takandjandji, M. S A. Zein, Anita Rianti
Kode Jurnal: jpkehutanandd140217
