KASUS INFEKSI ALAMI: DIAGNOSA STREPTOCOCCUS AGALACTIAE DARI JARINGAN IKAN NILA (Oreochromis niloticus) MENGGUNAKAN POLYMERASE CHAIN REACTION
Abstract: Streptococcus
agalactiae merupakan salah satu bakteri penyebab streptococcosis pada ikan nila
(Oreochromis niloticus). Pada pertengahan tahun 2010, telah terjadi kasus
kematian dengan tingkat mortalitas tinggi pada budidaya ikan nila di tambak
bersalinitas rendah di Karawang-Jawa Barat. Diagnosa agen penyebab penyakit
tersebut dilakukan dengan teknik Polymerase Chain Reaction dengan menggunakan
pasangan primer spesifik Sdi252 dan Sdi61. Umumnya, identifikasi pathogen
(bakteri) dengan teknik PCR dilakukan dengan menggunakan koloni bakteri sebagai
bahan ekstraksi. Namun pada penelitian ini dilakukan isolasi DNA langsung dari
jaringan ikan yang menunjukkan gejala terinfeksi bakteri tersebut. Tujuan
penelitian ini adalah untuk mendapat informasi berupa jenis organ target
S.agalactiae yang dapat digunakan dalam proses ekstraksi DNA bakteri. Sampel
ikan sebanyak 3 ekor diambil jaringannya (otak, hati, limfa, dan ginjal) untuk
diekstraksi dengan metoda pemanasan. Pita positif pada 192 bp diperoleh dari
otak (2/3), hati (2/3), limfa (3/3) dan ginjal (2/2). Sebagai kontrol digunakan
isolat bakteri dari masing-masing otak ikan sampel. Hasil penelitian
menunjukkan bahwa ke-4 organ dapat digunakan sebagai sumber DNA untuk
identifikasi bakteri S.agalactiae, namun limfa yang menunjukkan hasil yang
paling konsisten pada ke-3 ikan sampel.
Keywords: diagnosa, PCR,
primer spesifik, Streptococcus agalactiae
Penulis: Lila Gardenia, Isti
Koesharyani, Yani Aryati
Kode Jurnal: jpperikanandd110045