DOCKING ANALOG KURKUMIN TURUNAN PIPERAZINDION DENGAN TUBULIN (1TUB) RANTAI B MENGGUNAKAN VINA DAN AUTODOCK


ABSTRAK: Program Autodock mampu memprediksi energi bebas dan konformasi ikatan antara fleksibelligan dan makromolekul target yang telah diketahui. Senyawa turunan dan analog kurkumin adalahligan yang telah banyak dihasilkan dan diuji aktivitasnya. Beberapa diantaranya memiliki khasiatyang lebih baik dari kurkumin. Enam senyawa turunan piperazindion, kurkumin, PGV-0, dan PGV-1dihitung energi optimasi geometrinya menggunakan density functional theory (DFT) – Gaussian. Ligan hasil optimasi dicari energi ikatan ligan dengan reseptor 1TUB rantai  melalui dockingmenggunakan Vina dan Autodock dengan metode Lamarckian Genetic Algorithm (LGA), traditionalGenetic Algorithm (tGA), dan Simulated Annealing (SA) Monte Carlo. Data energi ikatan (affinitas) terbaik yang diperoleh dianalisis dengan Anova: Two-Factor Without Replication (P=0,01). Hasildocking dengan semua metode menunjukkan bahwa senyawa analog kurkumin turunanpiperazindion mempunyai potensi ikatan lebih baik dibanding senyawa induknya
Kata Kunci: 1TUB, Autodock, docking, kurkumin, piperazindion
PENULIS: Broto Santoso
Kode Jurnal: jpfarmasidd110176

Artikel Terkait :