DOCKING ANALOG KURKUMIN TURUNAN PIPERAZINDION DENGAN TUBULIN (1TUB) RANTAI B MENGGUNAKAN VINA DAN AUTODOCK
ABSTRAK: Program Autodock mampu
memprediksi energi bebas dan konformasi ikatan antara fleksibelligan dan
makromolekul target yang telah diketahui. Senyawa turunan dan analog kurkumin
adalahligan yang telah banyak dihasilkan dan diuji aktivitasnya. Beberapa
diantaranya memiliki khasiatyang lebih baik dari kurkumin. Enam senyawa turunan
piperazindion, kurkumin, PGV-0, dan PGV-1dihitung energi optimasi geometrinya
menggunakan density functional theory (DFT) – Gaussian. Ligan hasil optimasi
dicari energi ikatan ligan dengan reseptor 1TUB rantai melalui
dockingmenggunakan Vina dan Autodock dengan metode Lamarckian Genetic
Algorithm (LGA), traditionalGenetic Algorithm (tGA), dan Simulated Annealing
(SA) Monte Carlo. Data energi ikatan (affinitas) terbaik yang diperoleh
dianalisis dengan Anova: Two-Factor Without Replication (P=0,01). Hasildocking
dengan semua metode menunjukkan bahwa senyawa analog kurkumin turunanpiperazindion
mempunyai potensi ikatan lebih baik dibanding senyawa induknya
Kata Kunci: 1TUB, Autodock,
docking, kurkumin, piperazindion
PENULIS: Broto Santoso
Kode Jurnal: jpfarmasidd110176
