EVALUASI MARKA PERTUMBUHAN MIKROSATELIT CCA08 PADA IKAN MAS RAJADANU TAHAN INFEKSI KHV DAN TUMBUH CEPAT
Abstract: Pemanfaatan marka
molekuler mikrosatelit dapat mempercepat kegiatan pemuliaan dalam memperbaiki
karakter genetik pada ikan. Saat ini telah dilaporkan lokus mikrosatelit Cca08
berasosiasi dengan karakter tumbuh cepat pada ikan mas. Penelitian ini
bertujuan untuk mengevaluasi lokus Cca08 pada populasi ikan mas Rajadanu tahan
infeksi KHV dan tumbuh cepat. Populasi ikan mas Rajadanu tahan infeksi KHV dan
tumbuh cepat merupakan hasil kegiatan pemuliaan dan koleksi Balai Penelitian
Pemuliaan Ikan. Evaluasi lokus Cca08 dilakukan pada lima populasi ikan mas
Rajadanu yaitu populasi P, F0, F1, F2, dan F3. Lokus Cca08 diamplifikasi
menggunakan primer spesifik mikrosatelit Cca08, hasil amplifikasi diseparasi
dengan alat analisa fragmen (Qiaxcell, Qiagen). Data alel mikrosatelit diolah
mengunakan program Microsoft excel dan dianalisis menggunakan program Fstat dan
Arlequin. Hasil penelitian menunjukkan bahwa lokus Cca08 dapat teramplifikasi
dan polimorfik pada populasi ikan mas Rajadanu tahan infeksi KHV dan tumbuh
cepat. Sebanyak empat alel terindentifikasi pada populasi ikan mas yang diuji
yaitu alel 140, 172, 180, dan 192, dengan genotipe yang teramati sebanyak tujuh
kombinasi genotipe. Frekuensi alel 180 dan genotipe 180/ 180 meningkat pada
populasi ikan mas Rajadanu hasil seleksi. Lokus Cca08 dengan genotipe 180/180
dapat dijadikan marka tumbuh cepat pada ikan mas khususnya strain Rajadanu.
Keywords: ikan mas; tumbuh
cepat; mikrosatelit; alel; genotipe; Cca08
Penulis: Khairul Syahputra,
Didik Ariyanto, Yogi Himawan, Flandrianto Sih Palimirmo
Kode Jurnal: jpperikanandd150619
