DESAIN PRIMER SPESIFIK UNTUK DETEKSI DINI PENYAKIT VIBRIOSIS PADA UDANG PENAEID
Abstract: Serangan Vibriosis,
yang disebabkan oleh Vibrio harveyi berpendar pada budidaya udang telah
menyebabkan penurunan yang signifikan dalam produksi, baik pada pembenihan
maupun di tambak pembesaran. Pengembangan metode deteksi cepat berbasis PCR
(Polymerase Chain Reaction) sangat penting untuk mencegah penularan vibriosis.
Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengembangkan metode cepat deteksi
vibriosis pada udang penaeid dengan menggunakan penanda molekuler yang
spesifik. PCR berbasis deteksi gen spesifik dilakukan menggunakan primer
spesifik toxR, haemolysin (vvh), dan gyrB. Dari 35 isolat, 22 isolat yang
terdeteksi memiliki gen spesifik toxR, haemolysin (vvh) dan gen gyrB dan 9
isolat terdeteksi memiliki dua gen tertentu. Penanda molekuler spesifik telah
dirancang menggunakan data urutan gen penyandi protein haemolysin dan gyrase.
Desain pasangan primer yang didasarkan pada program perangkat lunak dari
Primer3 dan secara manual menggunakan program perangkat lunak Bioedit. Tiga
pasangan primer untuk gen haemolysin dan dua primer gyrase telah diperoleh dan
dipilih sebagai primer.
Keywords: vibriosis, udang
penaeid, PCR, deteksi cepat, penanda molekuler spesifik
Penulis: Ince Ayu Khairana
Kadriah, Endang Susianingsih, Sukenda, Munti Yuhana, Enang Harris
Kode Jurnal: jpperikanandd130326
