Identifikasi Molekular dan Karakterisasi Morfo-Fisiologi Actinomycetes Penghasil Senyawa Antimikroba
ABSTRAK: Tujuan dari
penelitian yang dilakukan adalah untuk mengidentifikasi isolat actinomycetes
dengan kemampuan antimikroba menggunakan analisis 16S rDNA dan
mengkarakterisasinya secara morfologi dan fisiologi. Sebanyak delapan isolat
dengan aktivitas antibakteri dan antifungi tertinggi telah diidentifikasi
menggunakan 6 primer (20F, 520F, 920F, 1500R, 920R, and 520R). Karakter
morfologi dan fisiologi juga diamati dalam penelitian ini. Karakter morfologi
diamati berdasarkan parameter kunci berupa miselium aerial, bentuk rantai spora,
koloni dan produksi pigmen. Karakter fisiologi berupa aktivitas antimikroba,
suhu pertumbuhan, toleransi keasaman (pH), konsentrasi salinitas, asimilasi
gula dan produksi enzim khusus (arginin dihidrolase, urease, ß-glukosidase,
protease dan ß-galaktosidase). Berdasarkan persamaan homologi melalui metode BLAST
dan analisis pohon filogenetik, semua isolat teridentifikasi sebagai
Streptomyces. Isolat tersebut teridentifikasi menjadi tujuh jenis. Isolat
RC-SS-37-4, RC-SS-37-16 dan BL-22-3 berturut-turut teridentifikasi sebagai
Streptomyces costaricanus (100 %), Streptomyces costaricanus (99.8 %) dan
Streptomyces parvulus (98.6 %). Lima isolat teridentikasi sebagai Streptomyces
spp. (BL-36-1, BL-20-2, BL-14-2, BL-22-1 dan BL- 06-5) dan merupakan kandidat
jenis baru karena memiliki nilai homologi yang rendah terhadap jenis terdekatnya.
Penulis: Arif Nurkanto &
Andria Agusta
Kode Jurnal: jpbiologidd150835
