Klasifikasi Data Microarray Menggunakan Discrete Wavelet Transform dan Extreme Learning Machine

Abstrak: Data microarray digunakan sebagai alternatif untuk diagnosa penyakit kanker karena kesulitan dalam dignosa kanker berdasarkan bentuk morfologis, yaitu perbedaan morfologis yang tipis antar jenis kanker yang berbeda. Penelitian ini bertujuan untuk membangun pengklasifikasi data microarray. Proses klasifikasi diawali dengan reduksi dimensi data microarray menggunakan DWT, dengan cara mendekomposisi sampel hingga level tertentu, kemudian mengambil nilai koefisien aproksimasi pada level tersebut sebagai fitur sampel. Fitur tersebut selanjutnya menjadi masukan untuk klasifikasi. Metode klasifikasi yang digunakan adalah ELM yang diterapkan pada RBFN. Dataset yang digunakan adalah data microarray multikelas, yaitu dataset GCM (16.063 gen, 14 kelas) dan Subtypes-Leukemia (12.600 gen, 7 kelas).
Pengujian dilakukan dengan cara membagi data latih dan data uji secara random sepuluh kali dengan proporsi data yang sama. Classifier yang dihasilkan dari penelitian ini untuk dataset GCM belum memiliki performa yang cukup baik, ditunjukkan dengan nilai akurasi sekitar 75% ± 6,25% dan nilai minimum sensitivity yang masih rendah, yaitu 15% ± 19,95% menunjukkan bahwa sensitivity untuk tiap kelas belum merata, terdapat beberapa kelas yang sensitivity-nya masih rendah. Namun, classifier untuk dataset Subtypes-Leukemia yang memiliki jumlah kelas lebih sedikit dari dataset GCM memiliki performa yang cukup baik, ditunjukkan dengan nilai akurasi 87,68% ± 2,88% dan minimum sensitivity 51,90% ± 20,29%.
Kata kunci:  microarray, ekspresi gen, DWT, ELM, RBFN
Penulis: Khadijah, Sri Hartati
Kode Jurnal: jptinformatikadd150272

Artikel Terkait :