Analisis Kinerja Model Pengontrol Ekson DNA Menggunakan Metode Model Hidden Markov
Abstrak: urutan Deoxyribo asam
nukleat (DNA) yang memiliki beberapa bagian ekson dalam urutan coding (cd)
adalah bagian penting dalam proses biologis untuk menghasilkan protein. Tujuan
dari penelitian ini adalah untuk mengontrol ekson DNA yang ada di CD dengan
menggunakan Hidden Markov Model (HMM) sehingga protein yang dihasilkan tidak
berubah. HMM metode memiliki parameter misalnya; negara, nilai keadaan
transisi, negara emisi dasar dan algoritma yang digunakan untuk pelatihan dan proses
pengujian. Nilai dari negara transisi secara acak berbagai ditentukan nilai
antara 0 ~ 1. Pelaksanaan HMM di ekson kontroler memiliki struktur model
20-negara dan tes simulasi dilakukan dengan menggunakan nilai negara transisi
dan jumlah urutan yang berbeda. Proses simulasi dengan struktur model 20-negara
adalah menghasilkan nilai kinerja model dengan Koefisien Korelasi (CC) adalah
0,7571 dengan menggunakan 220 urutan. Penelitian ini meningkatkan nilai CC
dengan cara mengelompokkan data dan hasilnya adalah 0,8808 untuk sub model
dengan 69 urutan dan 0,8183 dengan 157 urutan.
Penulis: Suhartati Agoes,
Binti Solihah, Alfred Pakpahan
Kode Jurnal: jptlisetrodd140691