OPTIMASI SUHU ANNEALING DAN AMPLIFIKASI 0,3 kb GEN rpoB DI HULU DARI RRDR PADA ISOLAT P16 Mycobacterium tuberculosis MULTIDRUG RESISTANT DI BALI DENGAN METODE POLYMERASE CHAIN REACTION

ABSTRAK: Mutasi di hulu dari RRDR diindikasikan sebagai adanya low level resistence [1].   Untuk mendapatkan titik mutasi di hulu dari RRDR maka perlu dilakukan amplifikasi fragmen DNA target. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui suhu annealing optimum untuk mengamplifikasi daerah hulu dari RRDR menggunakan  isolat P16 Multidrug Resistant Tuberculosis (MDR-TB) yang didapatkan dari RSUP Sanglah. Proses isolasi DNA dilakukan dengan metode Boom  termodifikasi. Deteksi  produk PCR dilakukan dengan elektroforesis gel agarosa 1,5% b/v dan divisualisasi pada alat UV Transiluminator. Hasil dari penelitian ini diketahui bahwa dengan proses PCR menggunakan sepasang primer FrL2 dan RevL2 dengan suhu annealing optimum 580C dapat mengamplifikasi daerah hulu dari RRDR berukuran 0,3 kb.
Keywords: M. tuberculosis; upstream RRDR; annealing temperature; PCR
Penulis: Putu Lita Astriani, Ketut Ratnayani, Sagung Chandra Yowani
Kode Jurnal: jpkimiadd140512

Artikel Terkait :