AMPLIFIKASI DAN IDENTIFIKASI MUTASI PADA FRAGMEN 0,5 KB GEN rpoB ISOLAT 134 Mycobacterium tuberculosis MULTIDRUG RESISTANT DENGAN METODE NESTED POLYMERASE CHAIN REACTION
ABSTRAK: Telah dilakukan
penelitian yang bertujuan
untuk mengamplifikasi dan
mengidentifikasi mutasi pada fragmen 0,5 kb gen
rpoB pada isolat 134 Mycobacterium tuberculosis multidrug resistant (MDR). Amplifikasi
dilakukan dengan menggunakan metode nested polymerase chain reaction
(nested PCR) sedangkan sekuensing dilakukan satu arah menggunakan forward inner
primer. Sekuen nukleotida yang diperoleh ditranslasi menjadi asam amino dengan menggunakan
program MEGA4. Fragmen 0,5 kb gen
rpob M.tuberculosis telah berhasil
diamplifikasi dengan metode
nested PCR dandisekuensing. Hasil alignment menggunakan
program MEGA4 menunjukkan bahwa telah terjadi missense mutation pada gen rpoB
isolat 134. Perubahan dua asam amino yang terjadi pada protein rpoB adalah asam
glutamat menjadi asam aspartat pada kodon 418 serta glutamin menjadi arginin
pada kodon 510.
Penulis: Made Dharmesti
Wijaya, I Nengah Wirajana, dan Sagung Chandra Yowani
Kode Jurnal: jpkimiadd140498
