KARAKTERISASI GEN PENYANDI PEDIOSIN PAF-11 PADA Pediococcus acidilacticiF-11
ABSTRAK: Pediosin PaF-11
merupakan peptida antimikrobia yangdisintesis secara ribosomal yang dihasilkan
oleh Pediococcus acidilactici F-11. Penelitian ini bertujuan
untuk mengetahui lokasi
dan sekuen nukleotida
gen yang terlibat
dalam produksi pediosin
PaF-11. Hasil penelitian menunjukkan bahwa proses curing
pada P. acidilactici F11menyebabkan hilangnya aktivitas pediosin PaF-11 yang
dihasilkan, mengindikasikan bahwa
gen pediosin PaF-11 berada
dalam plasmid. Hasil elektroforesis agarose DNA
plasmid P. acidilactici F-11 dengan
marker λDNA/HindIII menunjukkan
bahwa gen P. acidilacticiF-11 terbawa
dalam plasmid 12 kb. Amplifikasi gen pediosin PaF-11 dari P. acidilacticiF-11
menunjukkan bahwa kultur P. acidilacticiF-11 tanpa curingmengandung DNA plasmid,
diindikasikan dengan gen papA (256 bp). Pada kultur P. acidilacticiF-11 dengan
curing, plasmid tereliminasi, ditunjukkan oleh tidak terdeteksinya DNA aplikon.
Hasil ini menunjukkan juga bahwa gen
pediosin PaF-11 di
bawa dalam plasmid.
Diketahui bahwa sekuen
nukleotida gen penyandi
pediosin PaF-11 sebagai berikut : atgaaaaaaa ttgaaaaatt
aactgaaaaa gaaatggcca atatcattgg tggtaaatac tacggtaatg gggttacttg tggcaaacat
tcctgctctg ttgactgggg taaggctacc acttgcataa tcaataatgg agctatggca tgggctactg
gtggacatca aggtaatcat aaatgctag. Hasil penjajaran urutanbasa nukleotida
menunjukkan bahwa gen penyandi pediosin PaF-11 pada P. acidilacticiF-11 memiliki sekuen yang sama
dengan gen penyandipediosin PA.1 pada P. acidilacticiPAC1.0 dan P.
acidilacticiK10, pediosin AcH pada P. acidilacticiLB 42-923 danP .
parvulusATO77, serta pediosin CP2 pada P. acidilacticiMTCC 5101.
Kata kunci: pediosin
PaF-11, Pediococcus acidilactici F-11,
gen penyandi, lokasi gen, sekuen nukleotida
Penulis: Tri Marwati, Nur
Richana, Eni Harmayani dan Endang S Rahayu
Kode Jurnal: jpbiologidd120491
