IDENTIFIKASI ALEL GENXa7PADA PLASMA NUTFAH PADI LOKAL PAREKALIGOLARA MELALUI UJI SEGREGASI FENOTIPE DAN GENOTIPE
ABSTRAK: Penyakit Hawar Daun
Bakteri (HDB) adalah salah satupenyakit utama pada padi. Diantara gen-gen
ketahanan terhadap penyakit HDB, gen Xa7masih dapat mengimbangi keragaman
patogen HDB di lapang. Salah satu aksesi plasma nutfah padi lokal tepilih
berdasarkan hasil penelitian dengan pendekatan allele miningadalah
Parekaligolara (Indica, IRN: 1541) yang diketahui memiliki alel gen Xa7. Tujuan
dari penelitian ini adalah mengidentifikasi alel gen Xa7yang terdapat pada
plasma nutfah padi lokal Parekaligolara dengan uji segregasi secara fenotipe
dan genotipe melalui persilangannya denganvarietas kontrol peka terhadap
penyakit HDB, TN1. Identifikasi dilakukan pada populasi F1 dan F2 dan
dianalisis segregasinya berdasarkan fenotipe respon ketahanannya dan genotipe
menggunakan marka SNP untuk gen Xa7. Hasil analisis menunjukkan bahwa variasi
alel Xa7yang terdapat pada plasma nutfah Parekaligolara (Indica, IRN: 1541)
menunjukkan segregasi alel yang
bersifat dominan, yang
lebih berkontribusi membentuk
sifat ketahanan terhadap
RasVIII dari patogen
HDB. Marka Xa7SNP8 bersifat polimorfis dalam menandai alel
gen Xa7 yang
terdapat pada varietas
Parekaligolara. Marka ini
dapat sebagai marker assisted selection,
untuk alel Xa7 pada
varietas Parekaligolara, apabila
varietas ini digunakan sebagai
tetua persilangan dalam
program perakitan galur padi tahan penyakit HDB.
Penulis: Dwinita W Utami, TS
Kadir dan A Nasution
Kode Jurnal: jpbiologidd120467
