OPTIMASI PCR DAN AMPLIFIKASI ITS DNA RIBOSOMAL Penicillium sp.LBKURCC29 DAN LBKURCC30 PENGHASIL SELULOSA ISOLAT HUTAN PRIMER GAMBUT CAGAR BIOSFER BUKIT BATU RIAU
Abstract: Penicillium sp.
LBKURCC29 dan LBKURCC30 merupakan kultur Penicillium sp. penghasil selulosa
isolat dari tanah hutan primer gambut kawasan pangkalan bukit cagar biosfir
Giam Siak Kecil Kec. Bukit Batu, Riau. Isolat fungi ini diisolasi DNAnya
menggunakan kit wizard genomic DNA purification (promega). Hasil ekstraksi DNA
kemudian dielektro-foresis menggunakan gel agarosa 0,8% dan diamplifikasi
rDNAnya menggunakan Polimerase Chain Reaction (PCR). Optimasi PCR untuk
menghasilkan produk sangat berpengaruh pada suhu annealing. LBKURCC29 dan
LBKURCC30 memiliki suhu annealing 470C. Optimasi suhu annealing ini dapat
dilihat dari pita yang diperoleh di bawah UV transiluminator setelah produk
amplifikasi PCR dielektroforesis mengunakan gel agarosa 1,2%. Optimasi ini
perlu dilakukan supaya diperoleh produk amplifikasi PCR ITS rDNA yang cukup
baik untuk menghasilkan sekuens DNA yang optimal untuk analisis filogenetik.
Penulis: Arfa Dewi, Fajar
Restuhadi, Titania T. Nugroho
Kode Jurnal: jpkimiadd140472
