OPTIMASI KONSENTRASI MgCl2 DAN SUHU ANNEALING PADA PROSES AMPLIFIKASI MULTIFRAGMENS mtDNA DENGAN METODA PCR
ABSTRAK: Polymerase Chain
Reaction (PCR) merupakan metode amplifikasi Deoxyribonucleic acid (DNA) secara
in vitro. Hingga saat
ini para peneliti
baru berhasil mengamplifikasi secara
in vitro DNA
mitokondria (mtDNA) manusia Indonesia sampai ukuran
fragmen maksimal 1,6
kilobasa (kb) dan
belum dilakukan untuk
“banyak fragmen”
(multifragments). Pada penelitian
ini telah berhasil
diamplifikasi multifragments DNA
mitokondria manusia Indonesia berukuran
5,4 kb; 4,2 kb; 3,5 kb; 2,1 kb; 1,6 kb dengan metode PCR standar melalui
optimasi konsentrasi MgCl2dan suhu annealing. Proses
berlangsung dalam satu
reaksi PCR menggunakan
enzim taq polimerase, lima primer
yaitu dmt-2L, dmt-1H,
FL, FH dan MHpada
kondisi bufer standar
dengan konsentrasi MgCl22,5
mM, selama 30 siklus pada suhu
denaturasi 94oC (15 detik), annealing 65oC (30 detik) dan extension 72oC
(180 detik). Keberhasilan metode amplifikasi in vitro multifragments yang
mengandung fragmen panjang tersebut diharapkan
bisa membuat proses
amplifikasi beberapa gen
dalam satu genom
menjadi lebih cepat dan efisien.
Penulis: Mukhammad Asy’ari dan
A. Saifuddin Noer
Kode Jurnal: jpkimiadd050015
