OPTIMASI KONDISI PCR UNTUK ANALISIS VARIASI GENETIK MIKROSATELIT VARIAN JATI ARBORETUM DENGAN MENGGUNAKAN PEWARNAAN PERAK
ABSTRAK: Jati merupakan salah satu spesies perkebunan yang
menjanjikan di daerah tropis, maka perakitan calon tanaman jati unggul
diperlukan. Untuk itu dilakukan penelitian dengan tujuann menganalisis variasi genetik varian
jati arboretum dengan penanda mikrosatelit. Sebelum melakukan analisis variasi
genetik, terlebih dahulu dilakukan Optimasi kondisi PCR untuk berlangsungnya
proses amplifikasi DNA sampel. PCR peka terhadap sejumlah parameter meliputi:
magnesium klorida, DNA templat, konsentrasi primer, dan suhu annealing selama
amplifikasi. Kondisi reaksi dioptimalkan sebelum amplifikasi guna menghindari
produk amplifikasi tidak spesifik seperti ukuran pita DNA yang heterogen. Di samping itu penggunaan
pewarnaan perak juga perlu diperhatikan meliputi, komponen-komponen larutan
yang digunakan, tahapan-tahapan pewarnaannya harus benar-benar dilakukan sesuai
petunjuk dan butuh keterampilan serta kehatia-hatian. Hal ini dilakukan untuk
memperoleh pola pita DNA yang baik sehingga memudahkan analisis selanjutnya
dalam hal ini variasi genetik.
Penulis: Imas Cintamulya
Kode Jurnal: jpbiologidd120340
