STUDI INSILICO HUBUNGAN KUANTITATIF STRUKTUR-AKTIVITAS (HKSA)SENYAWA TURUNAN BENZIMIDAZOLE, DOCKING MOLEKUL, PENELUSURAN FARMAKOFOR, VIRTUAL SCREENING, UJI TOKSISITAS, PROFIL FARMAKOKINETIK SEBAGAI ANTI-TUBERKULOSIS
Abstrak: Telah dilakukan Telah
dilakukan penelitian studi hubungan kuantitatif struktur-aktivitas (HKSA),
docking molekul, penelusuran farmakofor, virtual screening, uji toksisitas, dan
profil farmakokinetik pada turunan Benzimidazole sebagai inhibitor DNA Gyrase
pada penyakit Tuberkulosis secara in silico. Penelitian ini bertujuan untuk
menemukan model persamaan HKSA senyawa, menemukan fitur-fitur farmakofor
senyawa yang bertanggung jawab atas
aktivitas dan selektivitas DNA Gyrase, serta memilih senyawa hasil virtual
screening yang kemudian ditentukan profil farmakokinetik, toksisitas, dan
toksisitas metabolit untuk pengobatan Tuberkulosis. Prosedur dimulai dengan
pemodelan dan optimasi geometri struktur molekul pada perangkat lunak HyperChem
8.0. Optimasi geometri dilakukan dengan metode Ab initio. Perhitungan
Deskriptor HKSA, penentuan fitur farmakofor dan docking molekul dilakukan dengan menggunakan perangkat lunak MOE 2009.
Selanjutnya pengujian toksisitas dengan perangkat lunak Toxtree dan AdmetSAR,
serta penentuan profil farmakokinetik dengan menggunakan program berbasis web
PreADME dilakukan untuk 150.000 senyawa natural product dari zinc database.
Dari penelitian didapatkan persamaan: Log 1/MIC = -8.6816 + 1.6938 AM1_LUMO +
0.0160 ASA_H – 3.9194 mr + 0.1087 VSA,
dimana r2 = 0,955 dan q2 = 0,8761, selanjutnya diperoleh hasil docking molekul
pada protein kode 2XCS, senyawa 23 menunjukkan nilai docking score (S)
-190.9309. Hasil virtual screening pada zinc database diperoleh senyawa dengan
kode ZINC08964902 adalah senyawa yang paling baik diantara 150.000 senyawa yang
dilihat dari sisi kecocokan pada query farmakofor, docking dengan metode
farmakofor, prediksi bioavailabilitas menggunakan rule of 5 Lipinski, dan
prediksi ADME/T
KATA KUNCI: Farmakofor; In
silico; Docking Molekul
Penulis: Nursalam Hamzah, Nur
Syamsi Dhuha, Reza Ramadhan
Kode Jurnal: jpfarmasidd150660
