KLONING GEN PUTATIVE CLEAVAGE PROTEIN 1 (PCP-1) PADA UDANG VANAME (Litopenaeus vannamei) YANG TERSERANG INFECTIOUS MYONECROSIS VIRUS
Abstract: Penanggulangan
penyakit ikan dapat dilakukan dengan cara meningkatkan kekebalan tubuh ikan
melalui program vaksinasi. Namun vaksinasi tidak tepat untuk udang, karena
udang tidak mempunyai immunological memory seperti ikan. Oleh karena itu,
perlindungan udang terhadap serangan penyakit viral dengan menggunakan RNA
interference (RNAi). Teknologi RNAi digunakan untuk menghalangi (interfere)
proses replikasi infectious myonecrosis virus (IMNV) pada udang vaname dengan
cara menon-aktifkan gen putative cleavage protein 1 (PCP-1), yang berfungsi
dalam pembentukan capsid dan proses transkripsi RNA IMNV. Penelitian ini
bertujuan untuk melakukan kloning gen putative cleavage protein 1 dalam rangka
perakitan teknologi RNAi untuk pengendalian penyakit IMNV pada udang vaname.
Tahapan penelitian meliputi koleksi sampel, isolasi RNA, sintesis cDNA,
amplifikasi PCR, purifikasi DNA, transformasi, isolasi plasmid, serta
sekuensing dan analisis data. Hasil isolasi plasmid cDNA PCP-1 memperlihatkan
semua koloni bakteri terseleksi ternyata membawa plasmid hasil insersi DNA gen
PCP–1, hasil sekuen dengan nilai homologinya mencapai 100% dan 99% yang
dibandingkan dengan sekuen di Genebank. Hasil penelitian menunjukkan bahwa
kloning gen putative cleavage protein 1 (PCP-1) dari udang vaname yang
terserang Infectious Myonecrosis Virus berhasil dikloning yang nantinya
digunakan untuk perakitan RNAi.
Keywords: Litopenaeus
vannamei; IMNV; gen PCP-1; kloning; Litopenaeus vannamei; IMNV; PCP-1 gene;
cloning; Litopenaeus vannamei; IMNV; PCP-1 gene; cloning
Penulis: Hessy Novita, Agus
Sunarto, Septyan Andriyanto
Kode Jurnal: jpperikanandd160194
