ISOLASI DAN KARAKTERISASI GEN PENYANDI PROTEIN VP-24 WSSV PADA UDANG WINDU (Penaeus monodon) UNTUK PENGEMBANGAN TEKNOLOGI RNAi
Abstract: Gen penyandi protein
struktural VP-24 WSSV merupakan gen yang mengkode salah satu sifat dari protein
struktural utama yang berada di lapisan perantara (intermediet) virus. Tujuan
dari penelitian ini untuk mengisolasi dan mengkarakterisasi gen penyandi
protein struktural VP-24 WSSV yang diisolasi dari udang windu, Penaeus monodon.
Genom DNA WSSV diisolasi dari kaki renang dan kaki jalan udang windu
menggunakan kit IQ 2000 dengan metode ekstraksi DTAB-CTAB. Gen tersebut
diisolasi dari udang windu yang positif terserang WSSV menggunakan primer VP-24
dan VP24-R dan dilanjutkan dengan sekuensing. Data yang dihasilkan dianalisis
menggunakan program Genetyx Versi 7 dan BLAST-N. Hasil penelitian menunjukkan
bahwa gen penyandi VP-24 WSSV berhasil diisolasi dari udang windu dengan
panjang sekuen sekitar 641-648 bp. Hasil alignment dengan BLAST-N menunjukkan
tingkat similaritas yang identik (99%100%) antara gen VP-24 yang diisolasi
dengan gen VP-24 yang ada di data base Bank Gen. Dari hasil ini disimpulkan
bahwa fragmen DNA hasil amplifikasi PCR tersebut merupakan sekuens gen penyandi
protein struktural VP-24 WSSV. Gen ini diyakini mampu mengkode karakter penting
penyakit WSSV yang utama yaitu VP-24.
Keywords: isolasi;
karakterisasi; gen VP-24; WSSV; udang windu
Penulis: Andi Tenriulo, Bunga
Rante Tampangallo, Andi Parenrengi, Riani Andang Dewi
Kode Jurnal: jpperikanandd150677
