DNA BARCODING IKAN HIAS INTRODUKSI
Abstract: Identifikasi spesies
menjadi tantangan dalam pengelolaan ikan hias introduksi baik untuk tujuan
budidaya maupun konservasi. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan
identifikasi molekuler ikan hias introduksi yang beredar di pembudidaya dan
pasar ikan hias Indonesia dengan menggunakan barcode DNA gen COI. Sampel ikan
diperoleh dari pembudidaya dan importir ikan hias di kawasan Bandung dan
Jakarta. Total DNA diekstraksi dari jaringan sirip ekor dengan menggunakan
metode kolom. Amplifikasi gen target dilakukan dengan menggunakan primer
FishF1, FishF2, FishR1, dan FishR2. Hasil pembacaan untai DNA disejajarkan
dengan sekuen yang terdapat pada genbank melalui program BLAST. Identifikasi
dilakukan melalui kekerabatan pohon filogenetik dan presentasi indeks kesamaan
dengan sekuen genbank. Hasil identifikasi menunjukkan sampel yang diuji terbagi
menjadi lima grup, yaitu: Synodontis terdiri atas lima spesies, Corydoras:
empat spesies, Phseudoplatystoma: tiga spesies, Botia: tiga spesies, dan
Leporinus: tiga spesies dengan nilai boostrap 99-100. Indeks kesamaan sekuen
menunjukkan sebanyak 11 spesies memiliki indeks kesamaan 99%-100% dengan data
genbank yaitu Synodontis decorus, Synodontis eupterus, Synodontis greshoffi,
Botia kubotai, Botia lohachata, Rasbora erythromicron, Corydoras aeneus,
Gyrinocheilus aymonieri, Eigenmannia virescens, Leporinus affinis,
Phractocephalus hemioliopterus. Dua spesies teridentifikasi sebagai hasil
hibridisasi (kawin silang) yaitu Leopard catfish (100% identik dengan
Pseudoplatystoma faciatum) dan Synodontis leopard (100% identik dengan
Synodontis notatus). Hasil analisis nukleotida penciri diperoleh tujuh
nukleotida untuk Synodontis decora, 10 nukleotida untuk Synodontis tanganyicae,
13 nukleotida untuk Synodontis euterus, empat nukleotida untuk Synodontis
notatus, dan 14 untuk Synodontis grashoffi. Kejelasan identifikasi spesies ikan
menjadi kunci utama dalam budidaya, perdagangan, manajemen, konservasi, dan
pengembangan ilmu pengetahuan.
Keywords: ikan introduksi; DNA
barcoding; BLAST; invasive alien species (IAS); introduction fish; DNA
barcoding; BLAST; invasive alien species (IAS)
Penulis: Melta Rini Fahmi,
Ruby Vidia Kusumah, Idil Ardi, Shofihar Sinansari, Eni Kusrini
Kode Jurnal: jpperikanandd170128
