PENENTUAN KONSENTRASI MINIMAL DNA UNTUK MENDETEKSI KOI HERPES VIRUS (KHV) DENGAN METODE POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR)
Abstract: Koi herpes virus
(KHV) adalah virus yang menginfeksi ikan mas dan koi yang dapat menyebabkan
kematian massal. Kerugian ekonomi yang diakibatkan kematian massal ikan dapat
dihindari apabila serangan KHV dapat dideteksi sedini mungkin. Metode deteksi
KHV dilakukan dengan mengikuti prosedur yang tertuang dalam SNI 7547:2009.
Salah satu metode deteksi cepat koi herpes virus adalah dengan teknik
Polymerase Chain Reaction (PCR). Keberhasilan analisis PCR sangat dipengaruhi
oleh beberapa faktor, di antaranya adalah karakteristik DNA genom yang meliputi
ke-murnian, konsentrasi, dan ukuran template. Konsentrasi dan kualitas DNA
dipengaruhi oleh keberhasilan pada saat melakukan ekstraksi DNA. Kegiatan
percobaan ini ber-tujuan untuk mengetahui konsentrasi minimal yang masih
terdeteksi dengan metode PCR. Pengukuran konsentrasi minimal dilakukan dengan
menguji sampel DNA genom yang konsentrasinya diencerkan secara bertingkat,
mulai dari 10-1, 10-2, 10-3, 10-4 sampai dengan 10-5. Hasil analisis PCR
menunjukkan konsentrasi DNA minimal yang masih dapat mendeteksi virus KHV
adalah 10-3 (0,15 µg/mL).
Keywords: KHV, konsentrasi
DNA, PCR
Penulis: Diah Artati
Kode Jurnal: jpperikanandd120470
