KLONING PROMOTER b-AKTIN DARI IKAN GURAMI (Osphronemus gouramy)
Abstract: Penelitian ini
dilakukan untuk mengisolasi promoter b-aktin (ggBA) dari ikan gurami
(Osphronemus gouramy). Sekuens promoter ggBA diisolasi menggunakan metode
“degenerate” PCR. Sekuensing dilakukan menggunakan mesin ABI PRISM 3100-Avant.
Analisis sekuens menggunakan program BLAST, GENETYX versi 7 dan TFBind. Panjang
sekuens DNA hasil kloning adalah sekitar 2,2 kb. Analisis BLAST menunjukkan
bahwa sekuens DNA hasil kloning memiliki kemiripan dengan sekuens gen b-aktin
ikan yang ada di Bank Gen. Sekuens hasil kloning memiliki faktor transkripsi
yang konserf untuk promoter b-aktin, yaitu: CCAAT, CC(A/T)6GG, dan boks TATA.
Posisi faktor transkripsi tersebut juga mirip dengan yang dimiliki oleh
promoter b-aktin dari ikan yang ada di Bank Gen. Dengan demikian dapat
disimpulkan bahwa fragmen DNA hasil amplifikasi PCR tersebut merupakan sekuens
promoter b-aktin ikan gurami.
Keywords: kloning; promoter
b-aktin; gurami; degenerate PCR
Penulis: Estu Nugroho,
Alimuddin, Anang Hari Kristanto, Odang Carman
Kode Jurnal: jpperikanandd090388
