ISOLASI DAN ANALISIS GEN HORMON PERTUMBUHAN LELE (Clarias gariepinus Burch.)
Abstract: Isolasi gen hormon
pertumbuhan lele dumbo (C. gariepinus) dari hipofisa ikan merupakan sumber DNA
yang selanjutnya dapat digunakan sebagai cetakan untuk mengkopi gen tersebut
menggunakan primer Amc-GH-F dan Amc-GH-R. Fragmen DNA lele dumbo hasil isolasi
terdeteksi berdasar elektroforesis gel agarosa 1%. Amplifikasi gen penyandi
hormon pertumbuhan (Growth Hormone / GH) lele dumbo menggunakan primer Amc-GH-F
(5’-GCAGAAATGGCTCGAGGTAAGG-3’) dan Amc-GH-R (5’-CAGGGTGCAGTTGGAATCC-3’) dapat
mengkopi sekuen gen GH lele dengan ukuran fragmen PCR sekitar 1.400 bp.
Sementara amplikon gen GH American catfish (Rhamdia quelen) menggunakan primer
Amc-GH-F dan Amc-GH-R sebesar 1.465 bp. Hasil analisis sekuensing gen penyandi
GH menggunakan program BlastP dan Genetyx versi 7.0, menunjukkan bahwa sekuen
gen penyandi GH lele dumbo memiliki homologi 80% dengan sekuen GH C. gariepinus
pada bank gen (no. aksesi AF 416488.1), sehingga sebagian besar sekuen gen
penyandi hormon pertumbuhan ikan tersebut dapat diamplifikasi secara in vitro.
Keywords: isolasi; analisis;
gen hormon pertumbuhan; lele dumbo
Penulis: Ibnu Dwi Buwono, Nono
Carsono, Yuniar Mulyani
Kode Jurnal: jpperikanandd120405