Isolasi DNA Total Dan Optimasi Suhu Annealing Untuk Primer COX2 Pada Ikan Ompok eugeneiatus (Vaillant 1893) Asal Sungai Indragiri Hulu Riau
Abstract: Ikan selais Ompok
eugeneiatus (Vaillant 1893) merupakan fauna khas sungai paparan banjir yang
perlu dilestarikan. Teknik molekuler yang berkembang saat ini memungkinkan
eksplorasi penanda genetik. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk isolasi dan
mengamplifikasi DNA mitokondrial (mtDNA) yang dapat digunakan untuk menunjang
usaha konservasi dan perlindungan sumber daya genetik fauna paparan banjir. Otot
dari setiap sampel ikan diisolasi DNA totalnya, lalu dilakukan optimasi primer
COX2 dengan teknik PCR menggunakan empat pasang primer COX2. Molekul DNA total
pada ikan O. eugeneiatus telah didapatkan sesuai dengan protokol dari kit
isolasi DNA DNeasy Blood and Tissue dari Qiagen. Pasangan primer COX2_SA_F1 dan
COX2_SA_R1 dengan suhu annealing 49 oC menghasilkan pita yang paling baik dalam
visualisai hasil optimasi primer dengan ukuran 660pb pada O. eugeneiatus
sehingga dapat digunakan sebagai primer dalam mendapatkan fragmen COX2 dengan
menggunakan teknik PCR.
Penulis: JESSICA RODEARNI
SARAGIH, ROZA ELVYRA, DEWI INDRIYANI ROSLIM
Kode Jurnal: jpbiologidd160518
