AMPLIFIKASI DAN IDENTIFIKASI MUTASI REGIO PROMOTER inhA PADA ISOLAT Mycobacterium tuberculosis MULTIDRUG RESISTANCE DENGAN TEKNIK POLYMERASE CHAIN REACTION
ABSTRAK: Sekitar 8-20% isolate
M. tuberculosis yang resisten terhadap isoniazid diketahui telah mengalami
mutasi pada posisi regio promoter inhA [1]. Untuk memperoleh titik mutasi pada
regio promoter, maka amplifikasi fragmen target perlu untuk dilakukan. Tujuan
dilakukannya penelitian ini adalah untuk mengamplifikasi regio promoter inhA,
mengetahui ada tidaknya mutasi dan jenis mutasi pada isolat 134 MDR-TB. Tahap
isolasi DNA dilakukan menggunakan metode Boom yang telah dimodifikasi. Fragmen
target diamplifikasi dengan teknik PCR menggunakan sepasang primer (forward
primer 5’ ACATACCTGCTGCGCAAT 3’ dan reverse primer 5’ CTCCGGTAACCAGGACT GAA
3’). Amplikon disekuensing secara satu arah menggunakan forward primer.
Analisis homologi dilakukan menggunakan program online BLASTn, sementara
identifikasi mutasi dilakukan menggunakan software MEGA4. Hasil penelitian
menunjukkan bahwa analisis homologi isolate 134 terhadap M. tuberculosis H37Rv
adalah sebesar 99%. Tahap analisis mutasi menemukan terjadinya perubahan sitosin
menjadi timin (CàT) pada posisi -15 isolat 134 MDR-TB
Penulis: Devita Kusdianingrum,
Sanna Yustiantara, Sagung Chandra Yowani
Kode Jurnal: jpkimiadd140507