Kejadian Indel Simultan pada Intron 7 Gen Branched-Chain α-Ketoacid Dehydrogenase E1a (BCKDHA) pada Sapi Madura
ABSTRAK: Sapi Madura
merupakan salah satu
bangsa sapi lokal
Indonesia yang berasal
dari persilangan sapi
Zebu (Bos indicus) dan banteng (Bos javanicus). Branched-chain α-ketoacid dehydrogenase (BCKDH) adalah salah satu dari kompleks enzim utama yang ada di membran
dalam mitokondria yang memetabolisme
branched chain amino acid (BCAA),
yaitu valin, leusin,
dan isoleusin. Keragaman
runutan nukleotida suatu
gen sangat menentukan
efisiensi dari enzim yang disandikannya. Tulisan ini bertujuan untuk
mengidentifikasi variasi nukleotida yang terdapat pada ruas intron
7, ekson 8,
dan intron 8
gen BCKDHA pada
sapi Madura. Penelitian
ini dilakukan terhadap
tiga peruntukan sapi Madura,
yaitu sapi karapan
(balapan), sapi sonok
(pajangan), dan sapi
sayur (pedaging). Hasil analisis menunjukkan bahwa variasi pada
intron lebih tinggi dibandingkan dengan ekson. Indel simultan ditemukan pada posisi
basa ke-34 dan 68 pada
sapi sonok. Selain
itu, ditemukan varian
C266T pada sapi
pedaging. Varian-varian tersebut
tidak menyebabkan terjadinya
perubahan asam amino
yang signifikan. Tidak
ada mutasi khusus pada ruas intron 7, ekson 8, dan
intron 8 yang ditemukan pada peruntukan sapi Madura. Hal ini menunjukkan tidak adanya
diferensiasi peruntukan sapi Madura dari sisi tekanan seleksi terhadap gen
BCKDHA.
Penulis: Asri Febriana, Achmad
Farajallah, Dyah Perwitasari
Kode Jurnal: jppertaniandd150185
