OPTIMASI KONDISI REAKSI PCR GEN CpTI (Cowpea trypsin inhibitor) PADA TANAMAN JARAK PAGAR
ABSTRAK: Kebutuhan bahan bakar
minyak yang semakin meningkat mengakibatkan perlu adanya upaya memanfaatkan
sumber energi terbarukan. Alternatif yang ideal adalah memanfaatkan jarak pagar
karena potensi minyak bijinya yang dapat dipakai sebagai biodiesel
dan dapat mereduksi
emisi gan CO2.
Sebelum melakukan analisis
lebih lanjut, perlu
dilakukan optimasi kondisi reaksi
PCR dengan primer gen CpTI. Optimasi prosedur PCR merupakan proses yang
kompleks dan memakan banyak waktu karena
meliputi pengaturan beberapa
parameter yaitu MgCl2,
DNA template, konsentrasi
primer, dan suhu annealing selama amplifikasi. Optimasi ini
berguna untuk menghindari produk amplifikasi yang tidak spesifik seperti
munculnya smear dan tidak adanya kesesuaian dengan ukuran gen CpTI yaitu 415
bp. Hasil penelitian ini adalah menemukan suhu annealing yang cocok digunakan
yaitu pada suhu 48 ºC karena menghasilkan pita DNA yang sesuai dan tidak
terlalu banyak smear.
Penulis: Poppy Rahmatika
Primandiri, Maftuchah
Kode Jurnal: jpbiologidd130335
