Studi Interaksi Molekuler UGPase pada Tanaman Umbi Berdasarkan Keberadaan Glukomanan
ABSTRAK: UGPase merupakan
enzim kunci yang memengaruhi terbentuknya polisakarida dengan ikatan β 1-4 glukosida.
Interaksi enzim UGPase
dengan subtrat (UDP-Glukosa)
pada beberapa spesies
tanaman umbi terdapat perbedaan.
Berdasarkan hal itu, tujuan penelitian
ini adalah untuk mengetahui interaksi UGPase dan
UDP-G pada beberapa
tanaman umbi. Hasil
molecular docking menunjukkan
interaksi catalytic domain dari
enzim UGPase yang
berikatan dengan UDP-G
pada substrate binding
loop, dengan total ΔG pada A.
konjac paling rendah yaitu -5,06 kcal/mol diikuti oleh I. batatas dan S.
tuberosum secara berturut-turut sebesar -4,60 dan -3,73 kcal/mol dan
distabilkan dengan dua tipe interaksi yaitu interaksi elektrostatik dan
hidrogen pada A. konjac dan I. Batatas, serta interaksi hidrofobik pada S.
tuberosum.
Kata kunci: interaksi,
UDP-Glukosa, UGPase
Penulis: Muhammad Badiul Ulum,
Estri Laras Arumingtyas, Nia Kurniawan
Kode Jurnal: jpbiologidd130001
