Deteksi Keragaman Genotip Hibrid Ikan Lele Sangkuriang, Mutiara Transgenik dan Mutiara Non Transgenik pada Keturunan Pertama
Abstrak: Penelitian ini
dilakukan dengan tujuan untuk mendeteksi keragaman genotip dari lele
sangkuriang, mutiara transgenik, mutiara non transgenik dan hibridnya dengan
marka RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) menggunakan 6 macam primer
(OPA-03 OPA-07, OPA-09, OPA-11, OPA-16 dan OPA-06). Metode yang digunakan dalam
penelitian ini adalah metode eksperimental secara eksploratif dengan analisis
deskriptif kualitatif. Hasil amplifikasi menunjukkan primer OPA-03
(5’-AGTCAGCCAC-3’) merupakan primer terbaik yang memvisualisasikan fragmen
(polimorfik dan monomorfik) pada seluruh sampel. Isolasi DNA genom ikan uji
menggunakan Wizard® Genomic DNA Purification Kit (Promega). Hubungan
kekerabatan dari ikan uji ditunjukkan dalam bentuk fenogram menggunakan program
NTSYSpc. Hasil analisis dari fenogram OPA-03 menunjukkan keturunan pertama
hasil persilangan lele jantan mutiara transgenik dan betina sangkuriang
memiliki keragaman genotip dibanding persilangan lainnya. Keturunan pertama dari hasil persilangan
induk dari strain yang sama (sangkuriang dan sangkuriang) memiliki kekerabatan
sebesar 70% (keragaman genotip 30 %), hasil persilangan antara mutiara non
transgenik dengan sangkuriang memiliki kesamaan genetik 79%. Indeks kesamaan
genetik tertinggi (82%) diperoleh dari keturunan pertama hasil persilangan
mutiara transgenik dengan sangkuriang.
Kata Kunci: keragaman, hibrid,
lele mutiara, lele sangkuriang, transgenik, keturunan pertama
Penulis: Asri Ulfah Lathifah,
Ibnu Dwi Buwono, Ujang Subhan
Kode Jurnal: jpperikanandd160594
