KERAGAMAN GENETIK POPULASI IKAN BERONANG ( Siganus guttatus ) DI SELAT MAKASSAR DAN TELUK BONE MENGGUNAKAN METODE RANDOM AMPLIFIED POLYMORPHIC DNA (RAPD)
Abstract: Penelitian ini
bertujuan untuk mengkaji keragaman genetik populasi ikan beronang di perairan
Selat Makassar dan Teluk Bone dengan metode random amplified polimorphic DNA
(RAPD). Sampel ikan beronang diperoleh dari tiga lokasi di perairan Selat
Makassar (Polman, Barru, dan Takalar) dan satu lokasi di perairan Teluk Bone
(Malili). Sebanyak 8 ekor ikan beronang dari tiap-tiap lokasi dipreservasi
dengan larutan TNES urea buffer. Ekstraksi DNA genom dengan metode
Phenol-Chloroform. Di antara tujuh screening primer, lima primer diseleksi
untuk analisis RAPD. Keragaman genetik dianalisis menggunakan software TFPGA
(Tools For Population Genetic Analysis). Kedekatan hubungan kekerabatan
ditampilkan dalam dendrogram. Hasil Penelitian menunjukkan bahwa ikan beronang
populasi Malili, Teluk Bone menghasilkan polimorfik tertinggi yaitu 63,24% dan
terendah dari populasi Barru, Selat Makassar yakni 40,30%. Indeks similaritas tertinggi
(0,83) diperoleh antara populasi Polman dan Barru, dan indeks similaritas
terendah (0,65) antara populasi Barru dengan populasi Malili. Hubungan
kekerabatan berdasarkan jarak genetik ikan beronang pada penelitian ini
diperoleh dua kelompok utama yaitu populasi Selat Makassar dan Teluk Bone.
Ketiga populasi ikan beronang asal perairan Selat Makassar merupakan satu
kelompok dan terpisah dari ikan beronang populasi Malili, Teluk Bone.
Keywords: keragaman genetik;
ikan beronang; Siganus guttatus; indeks similaritas; jarak genetic
Penulis: Samuel Lante, Andi
Tenriulo, Andi Parenrengi, Rachmansyah, Asmi Citra Malina
Kode Jurnal: jpperikanandd110235
